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扫描电镜作为一种基础显微成像工具，因具有超高的放大能力，从而被高校、科研院所、材料研发和质量分析部门广泛用于研发、生产过程。
相比于光学放大器件，扫描电子显微镜使用电子束进行成像，放大、分辨能力比光学显微镜有非常大的提升。
图1 金相样品光学显微镜图像 (左) 和扫描电镜图像 (右)
景深是一种普适用于所有的光学成像仪器的概念。所谓景深，就是照片中清晰图像的范围，景深越大，我们看到的视野中清晰的范围就越大，或称景深分辨能力强；反之，景深越小（浅），视野范围中能够清晰的范围越狭小，成像器材的景深分辨能力越弱（图2）。
图2 小景深和大景深
光学元件中，只有一个参数会直接影响景深分辨能力，那就是光束的收敛角的大或小。光束到达焦点后，收敛角越小，其得到的景深越深，例如在照相机中，光圈直径的减小会直接将收敛角减小，景深则越深（如图3）。
图3 照相机中光圈对景深的影响示意图
与光学显微镜相比，扫描电镜的成像介质（电子束）的汇聚性非常好，因此到达样品表面的电子束收敛角通常非常小，因而电镜的景深分辨能力往往比光学显微镜强（图4）。
图4 扫描电镜 (右) 明显比光学显微镜 (左) 具有更好的景深分辨能力
但是，我们也同样需要明确，扫描电镜的景深分辨能力并非无限大。在遇到一些极其特殊的样品时，比如几乎垂直放置的多层膜材料（图5），即使是扫描电镜也难以表现其全部细节。因此，需要通过一些图像处理手段，以更简单高效的方式就可以让电镜使用者直接得到大景深图片。
图5 近乎垂直放置的多层膜材料截面
首先，使用飞纳电镜的脚本开发工具写一个自动曝光程序，曝光一系列景深深度不同的图像（图6）。然后，使用 景深堆叠合成（Focus Stack Merging） 这一图像处理技术，再用图像识别和处理手段将每张照片中清晰的部分提取出来，最终合成一张全部区域清晰（景深较大）的图像（图7）。
由于是使用图像合成的方法进行运算合成，因此理论上使用这种方法可以获得景深无限大的样品图像，或称之为 超景深 图像。
图6 一组焦距不同的图像堆叠 (Focus Stacking)
图7 图像景深合成 (Focus Merging) 前后效果比较
超景深图像可以满足大景深成像的应用场景，比如金属、水泥等材质的拉伸断口这类纵深较大的样品成像及分析（图8），获得超景深图像可以使研究人员轻松看到此类样品的全部细节。
图8 超景深使用场景 (左：复杂形状截面；右：多种材料拉伸断口)
