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手性化合物的分离就是外消旋体的一对对映体的拆分问题。而对映体除旋光方向相反外，其他物理性质或化学性质都相同，因此虽然外消旋体是两种化合物的混合物，但用一般的物理方法，例如蒸馏、重结晶等不能把一对对映体分离出来，必须采用特殊的方法才能把它们拆开。拆分的方法很多，有机械拆分、微生物拆分、选择吸附拆分、诱导结晶拆分和化学拆分等方法。在气相色谱仪中选择适当的吸附剂作固定相，通常是手性固定相，是指选择性的吸附外消旋体中的一种异构体，这样就可快速分离手性化合物。在气象色谱分析中利用将对映体分别与手性固定相结合的强度不同而达到分离的目的。这种拆分zui适用于酸和碱的外消旋体的拆分。对于那些非酸又非碱的外消旋体的拆分，就要设法在分子中引进酸性基团，然后按拆分酸的方法拆分之。1996年Gil-Av等采用手心固定相在毛细管气相色谱上对氨基酸对映体进行分离，这种技术是研究手性化合物的一种重要分析手段。这个方法可用来分离一些手性化合物，例如，氨基酸、 -氨基醇， -芳基醇、胺类、 -取代羧酸、环氧化合物、碳水化合物、螺缩酮类和拟除虫菊类等。
1.对映体通过手性固定相的分离机理人们为寻找更有效的手性固定相，对分离机理曾进行广泛而深入的研究，并提出了各种各样的见解。
2.1氢键作用 Ggil-Av和Parr等通过氢键络合物的形成来解释含肽链股定向的分离机理，也就是氨基酸的两个对映体分别与手性固定相结合成为非对映体化合物，由于氨基酸中的氢键结合强度不同，使流出顺序有先后，从而达到分离对映体的目的。 Gil-Av等以手性二酰胺或而肽固定相分离氨基酸对映体衍生物，例如，L- -氨基酸在手性固定相上分离时，形成一个氢键环，使L-对映体滞留，而D-对映体首先出峰。在这里连接不对称中心的烷基的定向，取决于不同手性固定相和被分离的氨基酸。
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